Constitué pour un an, renouvelable une fois, les groupes sont portés par deux responsables scientifiques. Ces groupes ont pour mission d'organiser des rencontres de formats différents et des communications scientifiques telles que des séminaires, des ateliers, des séances de lecture, des workshops, ou des data sprint... Ils répondent à des objectifs interdisciplinaires mais également d'ouverture vers les collectivités locales, les entreprises, la société civile. Ils s'inscrivent dans un ou plusieurs axes caractérisant l'identité scientifique de la MSHB.
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